目前，水面舰艇的垂直发射系统已不具备海上再装填弹药的能力，只有部分核潜艇（美国）可以进行海上垂直装弹（战斧）！
首先，水面舰艇的垂直发射再装填系统仅有美军研制并装备。美军MK41垂直发射装置的导弹从早期设计上可以海上再装填，但在实际使用中难以保证各种海况下安全、快捷地海上装填，因此基本放弃了海上再装填。如今的主力战舰垂直发射系统一般都有32~128个单元，具体数量根据舰艇承担的作战任务而异。通常情况下，军舰的垂发装置不会出现一次性将导弹全部发射出去的情况，特别是像阿利伯克级、爱宕级、世宗大王级一类垂发单元多的舰艇。同时，现代舰艇执行任务时都是编队行动，多艘舰艇、潜艇携带的弹药更加可观，执行任务前也会根据任务需求编制导弹混装方案，因此一般不会出现导弹不够用的情况。
当然，对于垂直发射装置进行海上装填，美军也曾进行过实践。美军对系统的要求是：装备在巡洋舰和驱逐舰上的MK-41垂直发射系统在昼夜五级海况条件下每小时装填10个导弹储存箱。具体在运行时，利用补给舰的“标准横向补给系统”，将导弹储存箱转移到舰艇的滑动吊点板，然后使用甲板上的起重机将导弹储存箱吊起移动到一个空的单元格的位置，然后将导弹储存箱插入单元格里。为此，早期型的伯克级驱逐舰MK41垂发系统预留了装填吊车的位置，占用了3个垂直发射单元，安装1台瑞典制造的伸缩式油压起重机，平时起重机收藏在装甲舱盖下面，工作时伸出甲板并伸开起重臂，其臂长8.15m，起吊高度为7.62m，起吊质量2t，能对8隔舱模块中的所有弹位进行海上补给，补给速度为10吨/小时。
但是，美军这种垂直发射系统在海上补给技术实际评估中表现不佳，装载有标准2型导弹的储存箱传输速率只有3枚/小时，甚至远低于美国海军60年代“快速自动穿梭传送系统”在夜晚6级海况下每小时输送24枚“鞑靼人”防空导弹的水平。这主要是因为垂直发射系统尺寸较大，导弹更长，弹药+密闭发射筒重量更重，而且垂直装载在吊运操作时远没有倾斜式发射系统方便；同时，由于起重机必须塞进3个垂发单元的狭小空间，因此没有足够的力量吊起装有战斧导弹的储存箱，且三级海况下的摆动就会令起重机难以精准操作。因此，从伯克级的Flight IIA改型起，美军就撤掉了垂直发射系统的再装填装置，这样使得前后各增加了3单元的导弹。目前，美军MK41系统的导弹都是在港口进行装填。
实际上，最新型的垂发系统更多的采用了“一坑多弹”的技术，也就是一个垂直发射单元装填1~4枚导弹，这样在单元数量不变的情况下，大大提高了导弹装载数量，提高了整体作战能力。MK41就使用了“一坑四弹”的SSM增程海麻雀替换掉一部分标准3，增加了防空导弹的总数，提高了多目标对抗能力。
由于技术的进步，最新型水面舰艇不再单纯追求垂发装置的单元数量。提康德罗加级巡洋舰的128单元减少到了伯克级驱逐舰的96单元，又从伯克的96单元减少到了朱姆沃尔特级驱逐舰的80单元。这说明实际应用中并不存在导弹不够用的问题，现代化的驱逐舰更重视的是导弹的质量，而不再仅仅是导弹的数量。
其次，核潜艇垂直发射装置可以进行海上再装填！美国弗吉尼亚级核潜艇艇首装有12具垂直发射管，可以发射最新型的UGM-109E战术战斧导弹。这种导弹可以由潜艇支援舰进行海上垂直装填。
再次，美军或将重启新的垂发系统海上再装填项目。中国海军也应尽早启动类似项目的研制，为未来可能面对的高烈度海上对抗做好准备。据报道，美国新设计的再装填系统已经进行了测试，该系统可以在5级海况下进行垂直发射装置装填，其起、装速率预计是每小时15个导弹储存箱。新的补给装置是一种油压动力的机械吊臂，被安放在垂直发射装置甲板周围的三条永久安装的铁轨上，机械臂上有两个钳环的限位装置可以防止导弹储存箱晃动，然后通过电动绞车将空的垂直发射导弹储存箱吊起、传输装有导弹的储存箱并下舱贮存。
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