这个问题根本没办法进行比较
就好像你问姚明打篮球的技术和刘翔跨栏的技术哪个好一样
只能说你问的这两个专业在各自的业内比较而言的话，都还是可以的，我只是说可以
要真说区别，那就是电气工程相对就业面宽一点，而船舶与海洋工程就业面比较窄

九江职业技术学院的船舶电气自动化技术好?还是电气自动化技术好?

电气自动化技术专业
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电气自动化技术专业主要培养掌握电气技术、电力自动化技术、各种电气设备及自动化设备的基本原理和分析方法,能够从事供用电、各类电气设备、电气控制及自动化系统的安装、设计、调试、维护、技术改造、产品开发和技术管理的高级技术应用性专门人才。开设的主要课程有:高等数学、工程数学、英语、计算机文化基础、C语言程序设计、电工基础、模拟电子技术、数字电子技术、电机拖动基础、电力电子技术、自动控制系统、单片机与接口技术、工厂供电技术、工厂电气控制技术、PLC技术及应用、自动检测技术、计算机控制技术等。主要实践环节有:金工实习、电工实习、电力电子技术课程设计、电气控制课程设计、毕业实习(设计)等。学生毕业后可以在企事业单位的发电厂、供电系统、电气工程及自动化领域和用户单位、服务部门、销售部门从事供用电工程、自动化仪表、电气控制系统的工程施工、设备维护、维修、调试、技术改造和销售等工作。